Po śmierci Fałszywego Dmitrija Donswe i Terswe Kozacy napadli na miasto, brutalnie je splądrowali i zażądali uznania za króla kozackiego Wasilija Elagina, występującego pod imieniem Carewicza Piotra, syna Ojodora Goannowicza. W 1606 r. Astrachań został splądrowany przez tych samych Kozaków, a w 1607 r. lud astrachański, odmawiając uznania Wasilija Szujskiego za króla, sam dołączył do rebeliantów. W 1608 r. Zarutsyu pojawił się pod Astrachaniem z Mariną Mnishek, żądając posłuszeństwa od okolnichy Golovina i honorowej nagrody dla Mariny. Golovin, przebiegły człowiek energiczny, pozornie zgodził się na propozycję, ale już za pierwszym razem
Uroczysta ambasada miasta Zaruckiego nakazała śmierć wszystkich wysłanych, których było około 800 osób. Sam Zarutsy, tylko szczęśliwie nie poszedł ze swoimi posłańcami, uniknął ich losu. Jednak nie powiodło się w ataku Zaruckiemu, który przez prawie cztery lata nękał Astrachań. W 1660 roku Tatarzy podeszli do miasta ze znacznymi siłami, cały czas nie tracąc nadziei na ponowne zdobycie Astrachania i zdeterminowani, by tym razem go zdobyć. Mieszkańcy zamknęli się na Kremlu i postanowili chronić się do ostatniej możliwej okazji; Rozsądne rozkazy zarządcy Prozorowskiego i różne podjęte przez niego środki ostrożności sprawiły, że pierwszy atak wroga został odparty z tak ogromnymi szkodami, że opuścił miasto.
W 1670 roku Astrachań zajął Stenka Razin i tym razem przeżyła dzieciństwo, jakiego nie przeżyła ani wcześniej, ani później. Bez względu na to, jak energiczny był Prozorow, jakkolwiek pilnie przygotowywał się do upartej obrony, nie był w stanie uratować miasta, a gdy leżał ranny w katedrze na dywanie, a gorzko łkający metropolita żegnał św. Taina, w całym mieście doszło do oburzenia, a nieokiełznani Razinici dopuścili się okrucieństw, na które nawet w historii buntu Razina nie zawsze miało miejsce. Tłum Astrachania w całej swojej straszliwej nagości pokazał swoje krwiożercze, zwierzęce instynkty. Krew płynęła strumieniami ulicami miasta, niektórym pocięto, innym odcięto ręce i nogi, a jeszcze innym utopiono. Wszystko, co należało do klasy wyższej, zostało wytępione w celu oczyszczenia. Bez litości zabijano szlachtę, urzędników, kupców, a nawet zagranicznych urzędników. Kiedy uczestnicy zamieszek weszli do katedry, gdzie leżał gubernator i gdzie zniknęły tłumy szlochających kobiet i kobiet, rozpoczęły się gwałtowne szaleństwa; rannego gubernatora zrzucono z dzwonnicy, szlachtę i kupców ukrywających się w katedrze rozcięto mieczami przed katedrą, a ich zwłoki wrzucono do dużego dołu. Nie do zatrzymania
W całym mieście dochodziło do rabunków, rabowano nie tylko domy i place handlowe, ale nawet kościoły
Perski!Yanka.
nas. Pozostawiając zamiast tego Atamana Vaska Usę, aby rządził Astrachaniem, Stenka Razin popłynął w górę Wołgi. Vaska Us rządził miastem w taki sposób, że wszyscy byli mu posłuszni; Jedyną osobą, która nie podporządkowała się nowemu zarządzeniu, był metropolita astrachański Tosif*), na którego nie wzruszył się nawet sam Stenka Razin. Protegowany Stenki, Waska Us, okazał się okrutniejszy od swojego patrona, a święty, potępiając mieszkańców za zdradę stanu i podnosząc głos przeciwko powstańcom, uczcił męczeńską śmierć: po straszliwych torturach wyrzucono go z dzwonnicy katedry. Potem zmarł Waska Us, a Astrachań przejął ataman carycy Fedka Szeludjak. Dopiero w 1671 r
*) Metropolitów do Astrachania zaczęto mianować w 1667 r., zgodnie ze statutami cara Alekeja MinE I Chajłowicza, a w 1716 r. zastąpili ich biskupi.
roku Astrachań został odebrany zbójcom przez wojska carskie, które zbliżyły się do niego pod wodzą bojara Miłosławskiego.